Η κύρια διαφορά μεταξύ μιας κούπας και μιας κούπας καφέ είναι ότι η κούπα καφέ είναι συνήθως ψηλότερη και τα φλιτζάνια καφέ τείνουν να λεπτύνουν κοντά στο κάτω μέρος. Η πρώτη και πιο εντυπωσιακή διαφορά μεταξύ των δύο είναι το χαρακτηριστικό σχήμα των φλιτζανιών καφέ έναντι των φλυτζανιών καφέ. Μια κούπα καφέ, εξ ορισμού, είναι πιο ψηλή και τείνουν να λεπτύνουν πολύ λιγότερο (αν όχι καθόλου) προς το κάτω μέρος. Από την άλλη, το φλιτζάνι καφέ τύπου μπολ έχει πιο φαρδύ στόμιο και στενότερο πάτο.
Τα περισσότερα είδη φλιτζανιών καφέ είναι επίσης γενικά πιο εύθραυστα από μια κούπα. Τα φλιτζάνια καφέ τείνουν να είναι κατασκευασμένα από πορσελάνη, η οποία, αν και εξαιρετική για τη γεύση, τη διατήρηση της θερμότητας και την επίτευξη της σωστής πρόσληψης αέρα κατά την κατανάλωση, είναι εύθραυστη και σπάει εύκολα.
Οι κούπες καφέ τείνουν να είναι πιο στιβαρές: γι' αυτό συνηθίζετε να τις βλέπετε λιγότερο σε καφετέριες και πολύ περισσότερο σε σπίτια, γραφεία και εργαστήρια.